30 sierpnia 2001 po 16 latach pełnienia funkcji dyrektora na emeryturę odszedł Ryszard Wiszniewski. Jego miejsce zajął Zdzisław Janczuk, który pełnił swą funkcję do 2006 roku. Zastępcą dyrektora zostaje Grzegorz Klimaszewski.
Mimo iż warunki do pracy w samej szkole zaczęły się poprawiać – prowadzono zajęcia w 20 pracowniach i pracowni komputerowej. W bibliotece był dostęp do Internetu, stan budynków szkolnych zaczął się pogarszać, stąd konieczność pilnego remontu. W pierwej kolejności ze środków rezerwy budżetowej przeprowadzono remont pionu sanitarnego. Wykonano także elewację części budynku szkoły z dociepleniem.
W 2004 roku władze oświatowe przeprowadziły pomiar jakości pracy szkoły w sześciu obszarach, który wypadł dobrze. Duży wpływ na wyniki nauczania miała praca kadry pedagogicznej na zajęciach poza lekcyjnych. Koła przedmiotowe rozwijały zainteresowania uczniów a artystyczne uświetniały uroczystości szkolne i miejskie.
Według oceny wizytującej szkołę należy: monitorować i ewaluować program profilaktyczny, badać skuteczność kar i nagród, ustalić procedury rozstrzygania sporów i konfliktów. Przełomem w życiu szkoły była „Nowa matura” – 2005. Do egzaminu maturalnego przystąpiło 134 abiturientów. Szkoła osiągnęła w nim wynik wyższy od średniej wojewódzkiej.
Ważnym wydarzeniem dla szkoły w 2005 był pierwszy zjazd absolwentów – na tę uroczystość przybyli dawni nauczyciele i uczniowie.
Od nowego roku szkolnego 2006/2007 funkcję dyrektora po wygranym konkursie obejmuje Grzegorz Klimaszewski. Jego zastępczynią zostaje Małgorzata Iwanowska. W tym momencie naukę w szkole pobierało 395 uczniów, nie dokonano naboru do liceum dla dorosłych, ponieważ zgłosiło się zbyt mało zainteresowanych.
W roku 2007 rozpoczęły się prace związane z nadaniem imienia i sztandaru szkoły. W wyniku plebiscytu, w którym brali udział zarówno uczniowie, nauczyciele jak i rodzice, wybrano na patrona szkoły – Jana Pawła II.
Poprawiła się znacznie baza i estetyka szkoły. Odnowiono elewację pozostałej części budynku. Do użytku oddano ogrodzone boisko do piłki manualnej. Ze względu na unijne wymogi dostosowania szkoły dla osób niepełnosprawnych wybudowano windę i klatkę schodową. W celu poprawy bezpieczeństwa wprowadzono monitoring.
W październiku roku 2008 odbyły się uroczystości związane z nadaniem szkole imienia Jan Pawła II i poświęcenia ufundowanego przez społeczeństwo sztandaru. Uroczystość z udziałem władz wojewódzkich, powiatowych, oświatowych i kościelnych miała poważny charakter i artystyczną oprawę.
Do pracy szkoły przez cały czas bardzo aktywnie włączał się Samorząd Uczniowski, organizując imprezy szkolne o charakterze patriotycznym, okolicznościowym i rozrywkowym. Młodzież brała też udział w życiu miasta organizując imprezy dla społeczności gołdapskiej. Angażowała się także w działalność charytatywną – wolontariat, honorowe krwiodawstwo. Od roku 2007/2008 szkoła przystąpiła do projektu edukacyjnego „Archimedes” a w następnym roku do projektu „Aktywny uczeń”.
Rozwijają one zainteresowania uczniów, wzbogacają wiedzę z wielu przedmiotów, pozwalają uczniom lepiej przygotować się do matury. Wprowadzono także elektroniczny system kontroli wyników w nauce i frekwencji. W roku 2008 wznowił działalność Uczniowski Klub Sportowy „Jantar” dzięki czemu szkoła osiągnęła wiele sukcesów sportowych.
W roku 2010 szkoła aktywnie włączyła się do obchodów 440-lecia Gołdap, biorąc udział w paradzie młodzieży i przygotowując program artystyczny, prezentujący gołdapskie środowisko literackie.
W chwili obecnej w szkole pobiera naukę 395 uczniów. Kadra pedagogiczna liczy 35, w tym nauczycieli dyplomowanych 14, mianowanych 12, kontraktowych 9.
W roku 2010 minęło 60 lat od powstania Liceum Ogólnokształcącego w Gołdapi, w tej chwili im. Jana Pawła II.
Ryszard WRZOSEK








